Методы исследования - учёные применили комплексный подход:
1⃣ Провели библиометрический анализ 1826 публикаций о селене и старении за последние два десятилетия.
2⃣ Выявили гены, экспрессия которых меняется при старении мозга, на основе общедоступных наборов данных.
3⃣ Сопоставили эти данные с наборами генов, связанных с селеном.
4⃣ Использовали машинное обучение для отбора ключевых генов.
5⃣ Оценили результаты с помощью метода SHAP/номограмм.
6⃣ Проверили выводы на независимой выборке.
7⃣ Провели анализ иммунной инфильтрации и обогащения генов лекарственными препаратами.
8⃣ Подтвердили возрастные изменения в экспрессии генов и белков в тканях мозга мышей.
Ключевые результаты
1⃣ Рост научного интереса. За последние 20 лет количество публикаций о селене и старении неуклонно росло. Основные направления исследований: окислительный стресс, селенопротеины и когнитивные функции. При этом связь между селеном и когнитивными способностями остаётся относительно малоизученной.
2⃣ Выявленные маркеры. Перекрёстный анализ выявил семь потенциальных факторов, связывающих селен со старением мозга. С помощью машинного обучения отобраны три основных гена: SP1,
SEPHS2 и MSRB1.
3⃣ Ключевые игроки. Анализ SHAP и номограмм показал, что основными факторами, влияющими на дискриминацию в модели, являются SP1 и SEPHS2.
4⃣ Подтверждение на животных. Эксперименты на мышах подтвердили повышение экспрессии SP1 в стареющем мозге, снижение экспрессии SEPHS2 как на уровне мРНК, так и на уровне белка.